สาเหตุของอาการปวดฟันมักเป็นไปได้หลายอย่าง เป็นไปได้ทั้งปัญหาของฟันโดยตรงหรืออาจจะไม่ได้เกี่ยวกับฟันและช่องปากของเราเลยก็เป็นได้ สาเหตุของอาการปวดฟันที่พบทั่วไปมีดังนี้

• ฟันผุ สาเหตุส่วนใหญ่ที่ทำให้ปวดฟัน เนื่องจากมีเศษอาหารเข้าไปติดอยู่ในรูที่ผุนั้น มักมีอาการเสียวฟันเวลาดื่มน้ำร้อนหรือน้ำเย็น และขณะเคี้ยวอาหาร
• ฟันคุด ทำให้เจ็บปวดได้เช่นกันเพราะฟันเอียงไปดันฟันข้างเคียงและมักมีเศษอาหารไปตกค้างจนอาจเกิดหนองได้

• ฟันร้าวหรือฟันแตก ทำให้ความเย็นหรือความร้อนส่งถึงโพรงประสาทฟันและทำให้เกิดอาการปวดฟันได้
• ฟันสึก ทำให้เกิดอาการเสียวฟันเป็นครั้งคราว ถ้าฟันสึกจนถึงชั้นโพรงประสาทฟันก็จะทำให้ฟันตายและอาจต้องถอนฟันในที่สุด
• ฟันขึ้นในวัยเด็ก ในขณะฟันขึ้นอาจมีเหงือกอักเสบร่วมด้วย แต่จะหายไปเองเมื่อฟันโผล่พ้นเหงือกแล้ว

• โรคเหงือกอักเสบ ทำให้เหงือกแดงช้ำ มักมีสาเหตุมาจากคราบหินปูน มีอาการปวดหนึบ ร่วมกับแปรงฟันมีเลือดออก 
• การอักเสบของเนื้อเยื่อในโพรงประสาทฟัน มักเป็นผลจากฟันที่ผุลึกหรือแตกถึงโพรงประสาทฟัน ทำให้เกิดอาการปวดฟันขึ้นมาได้โดยไม่ต้องมีสิ่งใดมากระตุ้น และจะมีอาการปวดฟันมากและปวดอยู่นาน

• ปลายรากฟันอักเสบเป็นหนอง เกิดจากการลุกลามของการอักเสบของเนื้อเยื่อในโพรงประสาทฟัน ทำให้เกิดการติดเชื้อและเป็นหนองบริเวณปลายรากฟัน จะมีอาการเหงือกบวมและปวดฟัน
• โรคปวดเส้นประสาทใบหน้า เป็นอาการปวดที่เกิดจากการอักเสบของประสาทสมองเส้นที่ 5 ที่เลี้ยงบริเวณใบหน้าและศีรษะ ซึ่งอาจทำให้มีอาการเหมือนการปวดฟันได้

• หลังจัดฟัน อาการเจ็บฟันหลังจากใส่เครื่องมือจัดฟันเกิดจากการที่หลอดเลือดถูกกด จากแรงที่ดันฟันซึ่งเป็นการเริ่มต้นของขบวนการทำให้ฟันเคลื่อนที่ ซึ่งอาการนี้ไม่ถือว่าผิดปกติ และจะหายเองใน 3-5 วัน